5	6	1	6								
reference genotypes			1								
id	Site	loc1		loc2		loc3		loc4		loc5	
ref1	1	3	3	2	3	2	2	3	3	4	3
ref2	1	2	3	1	1	2	4	3	3	6	1
ref3	1	3	3	2	3	2	2	3	1	4	2
ref4	1	3	3	2	1	2	2	3	1	2	3
ref5	1	1	1	1	3	2	5	3	3	6	2
ref6	1	1	1	2	1	2	5	2	3	3	1
